結核の診断は時に困難である。 臨床において結核の診断を補助する検査は数多くあるが.これらの検査には一定の限界があり.結核の診断を困難にしている。 例えば.喀痰抗酸染色や喀痰結核培養は.これらの検査結果が陽性であれば基本的に結核の診断を確定できるが.多くの結核患者では上記の検査結果は陰性である。 複合DNA検査も結核の診断に有用であるが.結核患者の多くは複合DNA検査でも陰性である。 胸部CTや胸部X線写真も結核の診断に役立つが.多くの場合.結核の診断を確定するにも除外するにも十分ではない。 結核γインターフェロン放出試験やツベルクリン反応は結核の診断に有用であるが.これらの結果は陽性であり.活動性結核の診断を確定するものではない。 陰性でも活動性結核を否定するものではない。 まとめると.結核の診断は時に非常に困難であり.さらに診断を助けるために.ファイバースコープ気管支鏡下肺生検や病理検査のための経皮的穿刺肺生検が必要になることさえある。