慢性萎縮性胃炎の治療には、原因因子の除去、薬物療法などがありますが、がん化する可能性のある重度の萎縮性胃炎の患者さんには、外科的治療を考慮することが勧められています。
慢性萎縮性胃炎の具体的な原因は、今のところ完全には解明されていない。 慢性萎縮性胃炎には特異的な症状はなく、ほとんどの患者は胸やけ、腹部膨満感、食欲不振、吐き気、腹鳴（げっぷ）などを伴う。
慢性萎縮性胃炎の治療法としては、原因因子を取り除くこと、食生活の乱れを改善すること、例えば、冷たいもの、辛いもの、刺激物、消化の悪いものを避けること、飲酒を避けること、濃いお茶、濃いコーヒーを飲まないこと、生活習慣を整えること、十分な睡眠を確保すること、リラックスすることなどが挙げられます。
一方、薬物療法としては、胃粘膜を保護し、胃粘膜の自己修復を促進するチオ硫酸アルミニウム、クエン酸ビスマスカリウムなどの胃粘膜保護薬、消化不良を改善するポリペプチド錠や膵酵素錠などの消化促進薬、胃の蠕動運動を亢進し、胃排出を促進するドンペリドン錠などの胃運動改善薬がある。
経過観察の過程で、慢性萎縮性胃炎の患者が胃カメラによる病理検査の結果、癌の可能性を示唆する重度の異型過形成を示した場合は、癌を予防するためにできるだけ早く治療を受ける必要がある。
慢性萎縮性胃炎の患者はできるだけ早く病院の消化器科に行き、検査を済ませてから、医師の指導の下、積極的に治療を受けなければならない。