フィンガープリンティングは通常、臨床的に直腸フィンガープリンティングと膣フィンガープリンティングに分けられる。
1.直腸指診：医師は帽子とマスクを着用し、手を消毒し、患者に膀胱と腸を空にしてもらい、肘膝位、すなわち肘関節を曲げてベッドに置き、胸部をできるだけ診察ベッドに近づけ、膝関節を直角に曲げ、腰を高くする。 医師は右手に手袋をはめ、右手の人差し指に流動パラフィン、グリセリンなどの潤滑剤を塗布する。
まず、右手の人差し指を肛門の周囲に当て、軽くマッサージして肛門括約筋を弛緩させる。 肛門括約筋が弛緩した後、人差し指を肛門と直腸にゆっくりと挿入し、肛門の緊張を感じ、直腸の内壁が滑らかかどうか、圧迫感や痛み、感覚の変動がないかどうかを確認する。
2.膣診断：二重診断と三重診断に分けられる。 二重診断では、医師は滅菌手袋を着用し、片方の手の中指と人差し指に潤滑剤を塗り、ゆっくりと膣内に挿入し、膣、子宮頸部、子宮を確認する。 もう一方の手は患者の腹部に当て、患者の呼吸に合わせて子宮底を調べる。
トリプル診断では、医師は滅菌手袋を着用し、潤滑剤を塗り、片方の手を膣に、中指を直腸に挿入し、もう片方の手を下腹部に当てて触診を調整する。
触診が必要な場合は、通常の病院を受診することを勧める。