しゃっくりと下痢、水貯留は通常、急性胃腸炎、過敏性腸症候群、炎症性腸疾患などの病気と関係があり、原因によって一般治療、薬物治療、手術などの治療を行う。
1.急性胃腸炎：通常、不潔な食事と関係があり、診断後、経口補水塩を服用し、水分電解質障害を予防する。 細菌感染を伴う場合は、オキシフロキサシン、テトラサイクリンなどの内服と、下痢止めのモンテルカスト内服を同時に行う。
2.過敏性腸症候群（IBS）：下痢、腹痛、腹部膨満感を主症状とする機能性症候群。 乳酸菌とビフィズス菌を補充することで、腸管を整え、細菌の恒常性を調整することができる。 下痢がひどい場合は、モンテルカストなどの止瀉薬の併用が必要である。
3.炎症性腸疾患：急性期には、下痢、腹痛、発熱などの症状があるが、消化管に炎症刺激を与えて痙攣を起こし、しゃっくりなどの症状が現れることもある。 軽度から中等度の活動期の炎症性腸疾患はサラゾスルファピリジンでコントロールでき、プレドニンなどのグルココルチコイドも治療に使用できる。 穿孔、出血などを伴う場合は外科的治療を考慮する必要がある。
しゃっくりは下痢が原因であることが多いので、原因をはっきりさせ、的を絞った治療を行い、具体的には医師の指示に従うべきである。