重度の萎縮性胃炎はより重篤な胃炎に属し、ヘリコバクター・ピロリ感染を合併した萎縮性胃炎は4剤併用療法が必要であり、びらん性潰瘍を合併した萎縮性胃炎は制酸剤と粘膜保護剤を適用することができる。 1.ヘリコバクター・ピロリ感染を合併した萎縮性胃炎は、プロトンポンプ阻害薬とビスマス除菌を併用した抗生物質で治療することができます。 例えば、アモキシシリン、メトロニダゾールとオメプラゾールの併用、クエン酸ビスマスカリウムなどである。 2.びらん性潰瘍を合併した萎縮性胃炎は、酸阻害薬と粘膜保護薬を適用することができ、酸阻害薬にはプロトンポンプ阻害薬（オメプラゾール、ランソプラゾールなど）、H2受容体拮抗薬（ラニチジン、ファモチジンなど）などがあり、胃粘膜保護薬にはチオ硫酸アルミニウム、クエン酸ビスマスカリウム、コロイド状ビスマスペクチンなどが一般的な薬剤である。 重度の萎縮性胃炎の治療では、医師の処方に従わなければならず、やみくもに自己治療するのではなく、状態を悪化させないように、アスピリン、エリスロマイシンなどの胃粘膜を損傷する薬剤の使用は避けなければならない。