脳軟化症によるてんかんは、通常、自然治癒しない。
脳軟部病巣とは、脳出血、脳梗塞、外傷性脳損傷、脳炎などの破壊的病変によって脳組織が壊死・軟化し、脳脊髄液が充満して嚢胞状の軟部病巣が形成されることをいう。 いったん軟性脳底てんかんが形成されると、通常は回復が困難であり、軟性脳底てんかんが大きくなると発作を起こすこともある。 軟性脳底てんかんは自己限定性の疾患ではなく、自然治癒は困難である。
現在、脳軟化症に対する有効な治療法はなく、通常は対症療法が行われ、てんかんが誘発された場合は、医師の指示に従い、カルバマゼピン、フェニトインナトリウム、バルプロ酸ナトリウムなどの抗てんかん薬を治療に用います。
脳軟部病巣てんかんと診断された場合、患者は積極的に医師の治療に協力し、副作用を避けるために自己判断で薬を服用してはならない。