肺洗浄の副作用には、肺表面活性物質の減少、一過性の肺水腫などがあるが、これらに限定されるものではなく、通常、手術が適切に行われれば、徐々に自然軽快し、後遺症もない。 肺洗浄術は、肺結核の治療で最もよく行われる治療法の一つであり、肺機能を効果的に改善し、肺胞内の不純物（痰、結核菌）を除去し、呼吸器感染症の回数を減らし、肺の結核病巣を除去し、結核の蔓延を抑え、結核治療の経過を短縮することができる。 肺洗浄の副作用は以下の通りである： 1.肺表面の活性物質の減少：肺洗浄により、肺胞表面に分泌される活性物質の一部が取り除かれるが、これは肺自身が産生するもので、通常は一過性で自然に回復する。 2.一過性の肺水腫：肺のスケーリングの過程で、一過性の肺水腫が生じますが、これは軽度で、正常な肺機能には影響せず、呼吸困難には至らず、短期間で回復します。 肺洗浄の副作用として、麻酔事故、感染症、呼吸不全などが起こることがありますが、正規の医療機関に行くべきで、専門家による手術で、副作用の発生を抑えることができ、後遺症の遺産を避けることができます。