染色体陰性は慢性白血病では正常である。 染色体陰性は、黒子白血病の治療効果や予後の判定に用いることができる。 慢性白血病の特徴の一つはフィラデルフィア染色体が陽性であることである。 黒子白血病患者が治療後に再来院した場合、骨髄吸引や通常の血液検査に加えて、染色体検査を行うことができる。 治療（イマチニブ）後、フィラデルフィア染色体が陰性になれば、治療効果が比較的良好で、長期安定生存が得られることを示す。 染色体が再び陽性になった場合は、白血病が再発する可能性を示唆します。 チロシンキナーゼ阻害薬による慢性顆粒球性白血病の治療は、染色体や融合遺伝子のターンオーバーを達成し、治癒状態を得ることができるが、治癒後も再発の可能性があるため、医師の指導のもとで治療を受け、定期的な検査を受ける必要がある。