転移を合併した進行肝癌患者の予後は不良で、具体的な生存期間は個人差があり、平均生存期間は約13ヵ月しかないとする研究もある。 また、肝内転移、リンパ節転移、遠隔転移などの転移があることが多く、自然腹膜炎を起こし、肝性脳症を誘発する患者もいる。 癌の予後は一般的に生存率で評価され、肝癌の予後は病期などの進行度、治療方針、患者の基本状態などが関係する。 国内の研究では、進行肝癌の1年生存率は20％程度とする報告もあるが、まだ明確な結論は出ていない。 遠隔転移を合併した肝癌患者の平均生存期間は約13ヶ月とする国内研究もあるが、まだ明確な結論は出ていない。 進行肝がんと診断された患者は、通常の病院を受診して状態を評価し、医師の指示に従って治療に協力し、病気の進行を抑えて予後を改善することが推奨される。