肝内石灰化巣は一般に体内で消化吸収されにくく、関連する保存的治療は無効であるため、通常は臨床的に手術で除去される。 肝内石灰化巣は以前の肝障害の名残と考えられ、現時点では悪化の可能性は低いと思われる。 通常は外来での定期的な経過観察と観察で十分であり、特別な治療は必要ない。 しかし、肝内石灰化巣が大きくなると肝機能に重大な影響を及ぼすことがあり、その場合は腹腔鏡手術または開腹手術による摘出が考慮される。 薬物療法などの保存的治療は、肝内石灰化巣を縮小させる効果は低い。 肝内石灰化病巣を有する患者には、病巣の性質を観察するために、定期的な外来での経過観察が推奨される。 不快な症状があれば、医師の診察を受ける。