子供が脳炎に罹患しているかどうかの判断は、主に子供の臨床症状と補助的な検査に基づいて行われる。 まず、単純ヘルペスウイルス脳炎であれば、発症時に頭痛、吐き気、嘔吐などの明らかな変化がみられ、意識や性格にもわずかな変化がみられ、片麻痺、半盲、多動などの症状がみられる患者もいます。 ウイルス性脳炎の発症時期は、夏から秋にかけてが多い。 めまい、頭痛、全身痛、筋肉痛、食欲不振などのウイルス感染による全身症状が発症時にみられることがある。 結核性脳炎は、微熱、寝汗（就寝後に異常に汗をかき、起床後に汗が止まる）、精神不安定などの結核中毒症状を伴い、発熱、頭痛、吐き気、嘔吐などを伴うこともある。 新型クリプトコッカス脳炎の発症は、発熱、頭痛などの症状を伴い、より緩徐です。進行すると、易刺激性、記憶障害、重症例では意識障害などが見られます。 第二に、小児の髄膜炎は、臨床症状に加えて、脳脊髄液検査、CTやMRI検査などを併用して、明確な診断を下す必要があります。