核酸咽頭ぬぐい液の採取は、サンプラーの前端を試験管に挿入し、もう一方の手でサンプラーの柄を持ち、試験管の口に沿って下方向に力強く折って折る。 サンプリング綿棒の柄は通常ポリスチレン（またはABS）製で、中央に折れる箇所があるため、簡単に折って密封ボトルに入れることができる。 核酸咽頭ぬぐい液サンプリング綿棒は、咽頭ぬぐい液サンプラーとも呼ばれ、サンプリング後はサンプラーの前部分のみを保持し、サンプラーの手に触れる部分はサンプリング試薬に溶かすことができない。 咽頭ぬぐい液採取後、片手でサンプラーの柄を持ち、サンプラーの頭部を試験管に深く入れ、サンプラーの柄を下方に曲げ、破断点を通過させると、簡単にサンプラーを破断させることができ、サンプリングの前部は保持することができる。 採取の際、手に触れた部分はサンプリングチューブ内に保持できず、廃棄しなければ核酸検出精度に影響を与える可能性があるので注意が必要である。