腸管粘膜炎.分節性回腸炎.ヘリコバクター・ピロリ感染などの消化管の炎症性疾患は.不規則な便通や過度の鼓腸の主な原因である。 患者の消化管に炎症性病変が生じると.機能障害が出現し.細菌叢の割合が不均衡になる現象が起こるからである。 食物が消化管に入ると.正常に分解・吸収されないだけでなく.有害な細菌と過剰な代謝反応を起こし.大量のガス状物質が発生する。 ガスや栄養分は胃や腸の蠕動運動とともに下部消化管に入り込み.頻便.ガスの増加.下痢.水様便などの症状を引き起こす。 しかし.過敏性腸症候群.腸内細菌叢異常症.小腸吸収不良症候群などの非炎症性消化器疾患の可能性も否定できない。