お灸は、好きなだけ長くても短くてもよく、一般的に痛みなどの病気を治療する場合は、1つのツボにつき5～10分程度で十分であり、慢性的な症状を治療する場合は30分程度またはそれ以上かかります。 お灸は、もぐさ棒、もぐさ錐で作られたもぐさの葉を、人体のツボや燃焼の特定の部位に、陽気昇沈（沈んでいる臓器を持ち上げるために、体の陽気を上昇させること）、経絡を温め、寒気を散らす（人体の経絡を温め、体内の寒気を取り除くこと）、うっ血の除去、結び目の分散；病気の予防、健康管理、体の役割の強化などの効果があります。 お灸をする時間は決まっておらず、体の部位や病気の性質に合わせて行う。 頭と顔のツボは20分、手足と腰と背中のツボは25分、胸と腹のツボは30分が適当である。 一般的な疼痛疾患では、各ツボに5～10分灸を据えるだけで十分であり、慢性疾患や体力の低下した患者には、30分から1時間、あるいはそれ以上灸を据えることもある。 灸は徐々に行うべきで、灸を始めたばかりの患者は短く、しばしば灸をすえ、灸の時間は患者が心地よい程度にする。 患者はまた病気の特定の性質に従って処置の時間を延長するか、または短くすることができる。 お灸をするときは、怪我を避けるため、自己流ではなく、医師の指導のもとで行うことをお勧めします。