バイカウツギは様々な方法で調製できるが、主なものは、生のバイカウツギをスライスして天日で乾燥させたもの、ワインで作ったバイカウツギ、バイカウツギの炒め物、バイカウツギの炭である。 オウゴンにはそれぞれ異なる調製法があり、臨床での用途も異なる。 例えば、生のバイカウツギをスライスして天日で乾燥させたものは、清熱利湿（熱を取り除き、湿を乾燥させる）作用があり、主に湿熱病の治療に用いられる。 桂枝茯苓丸は主に桂枝茯苓丸の薄片に酒を混ぜて煮込み、濃い黄色になるまで炒め、冷ましてから使用し、肺熱を清める作用があり、主に肺熱咳嗽などの症状に用いられる。 柴胡桂枝湯は柴胡の薄切りを中華鍋で濃い黄色になるまで炒め、冷まして使用するもので、清熱（体内の熱や火を取り除く）、鎮静の作用があり、主に胎児の不穏などに用いる。 オウゴン炭は、オウゴンの薄片を鍋で表面が黄色く焦げ、内部も黄色く焦げるまで炒り、少量の水をかけて乾燥させたものである。 オウゴン炭には清熱・止血作用があり、主に吐血・喀血などの症状に用いられる。 オウゴン炭の使用は、医師に相談することが推奨され、自分で作って服用することはできない。