胆嚢結節というものは存在せず、ここでは胆嚢結石となる。 遺伝、脂質代謝異常、胆嚢動態異常、低繊維・高エネルギー食、細菌感染、薬剤などが胆嚢結石の要因である。
1.胆嚢結石の原因として、石灰化遺伝子と遺伝が挙げられる。胆嚢結石は、様々な、そして未知の遺伝子と環境の相互作用の結果として起こりうる。
2.脂質代謝障害、正常な脂質の輸送、分泌、代謝も胆石形成の重要な因子である。 高コレステロール血症は胆汁色素結石の形成につながる。
3.胆嚢動態の障害、ホルモンと神経の共同調節による生理的条件下での胆嚢収縮、最も重要な媒体はコレシストキニン（CCK）である。 胆石症患者では、CCKレセプターのmRNA発現が低下する結果、胆嚢の空腹時容積が増加し、最終的に胆嚢胆汁うっ滞や胆嚢結石形成につながる。
4.低食物繊維、高エネルギー食は胆汁コレステロール飽和度を上昇させ、結石形成を促進する。
5.細菌感染、一方では細菌感染による機能障害と胆嚢の炎症がコレステロール結石を誘発するメカニズムである可能性がある。
一方では、コレステロール結石の形成は細菌の代謝産物と関連している可能性がある。
6.セフトリアキソン、避妊薬など、ある種の薬剤は胆嚢結石形成につながる可能性がある。非合理的な減量法など、急激な体重減少は胆嚢結石形成につながりやすい。 肥満、脂肪肝、糖尿病、高血圧、高脂血症、運動不足、朝食抜き、胆嚢結石の家族歴などが胆嚢結石発生の要因になる可能性がある。