ハトムギは適応症の範囲内で、決められた用法用量を守って飲まなければならない。 便秘を引き起こす可能性があるという関連臨床情報はない。
ハトムギは温性で、補血・発汗、固表止汗（筋肉の表面を固めて発汗を止める）、補気昇陽（気を補い陽気を高める）、疏毒排膿（体内の膿や毒素を排出する）、収斂発筋（ただれを早く治し、新しい肉の成長を促進する）の作用がある。
中気沈下（脾胃の気虚で、内臓下垂などの症状が現れる）、表虚による自然発汗（筋肉の表層が弱く、自然発汗が頻発する）、肺虚による咳嗽、脾虚による下痢、肛門脱を伴う長引く下痢、出血や便潜血（月経過多や点滴）、黄芩による血虚、片麻痺（手足の片側が自由に動かせない）などの症状に用いる。
ハトムギの副作用と禁忌は明確ではない。 使用に際しては、表面に固い邪気が多い場合、食積滞（消化不良で胃に食物がたまること）、陰陽の亢進、癰疽（毒だれの一種で、体の表面や手足、内臓に起こる急性の化膿性疾患）の初期症状などに注意が必要である。
ハトムギは、限られた用法・用量の範囲内で服用すれば、現在の臨床応用では便秘の報告はない。
体調不良を感じた場合は、遅れないように医師の診断を仰いでください。 薬を服用する必要がある場合は、医師の指導のもとに服用し、生体への損傷を避けるために薬を使用せず、服用後、副作用がある場合は服用を中止し、適時に医師に相談すること。