褐色耳垢の原因は、生理的要因と耳垢圧入によるものとがある。
1.生理的要因：外耳道の軟骨皮膚には耳垢腺があり、耳垢を分泌することができる。 ほとんどの健康な人の耳垢は乾燥した薄片状で、黄色または褐色をしており、頭の位置の変化や顎関節の動きによって外側にはがれ落ちることがある。
2.外耳道耳垢塞栓症：外耳道への塵や埃などの侵入、様々な刺激による耳垢の過剰分泌、外耳道の瘢痕化、変形、狭窄、腫瘍などによる耳垢の外方への排出障害、耳垢の油性化、耳垢の劣化、高齢者の筋弛緩などによる耳垢の外方への排出障害などが原因で、耳垢が外耳道内で凝固して塊となり、外耳道を塞いで茶褐色の耳垢塞栓症を形成します。
耳垢栓塞は通常、耳垢フックをかけるか、5％炭酸水素ナトリウムで耳垢を軟らかくしてから温めた生理食塩水で洗浄し排出するか、吸引器を用いて除去することができる。
褐色耳垢は病院で診断され、医師の指示に従って治療されます。