新型クラウン遺伝子断片の検出は、主に分子生物学的および免疫学的手法によって行うことができ、通常、核酸抽出・検出、ウイルス捕獲、オンラインシークエンシング、配列解析の4つのステップを含む。
1.核酸抽出・検出：まず、検査担当者が核酸陽性症例などから検体を採取し、配列決定条件を満たすウイルス量の検体を選択し、遺伝子配列決定の準備を行う。
2.ウイルスの捕獲：新型コロナウイルスは比較的ウイルス量の少ないRNAウイルスであるため、新型コロナウイルスを検出するためには、専用のキットを用いて潜在的なRNA新型コロナウイルスをDNA断片に逆転写し、新型コロナウイルスの特徴に応じて個別に捕獲する必要がある。
3.オンボードシークエンシング：検出器は捕獲したウイルスを断片化し、その後のオンボードシークエンシングに備えて、シークエンサーが認識できるレベルまで断片を処理する。
4.シーケンス解析：シーケンサーは異なるシグナルに従って新しいコロナウイルスを同定し、スプライスし、特定のデータ結果を解析し、より正確で完全なシーケンスデータに変換する。
この一連のステップの完了後、データベースを徐々に比較することができ、その後のトレーサビリティ作業に役立つ。