心筋微小血管病変の一般的な症状には、胸部圧迫感、呼吸困難、episodic chest pain；疼痛、不整脈、全身症状などがある。
1.微小血管心筋虚血：主に微小血管内皮機能異常と微小血管循環障害に起因し、高血圧、高脂血症、糖尿病などの慢性疾患患者に多い。 主な症状は、胸部圧迫感、呼吸困難、エピソード性胸痛などである。
(1)胸部圧迫感：胸が詰まったような不快感があり、持続時間は通常30分以下である。
(2)呼吸困難：この疾患の典型的な症状。 冠動脈からの酸素供給不足により、呼吸困難、息苦しさ、不快感が生じる。
(3)エピソード性胸痛：胸痛はしばしば前胸部の圧迫様疼痛として現れ、通常持続時間は短いが、患者によっては退屈痛を主とする持続性疼痛を認めることもある。
(2)微小血管性心筋梗塞：ほとんどの患者は冠動脈病変を基盤に微小循環攣縮や塞栓症を起こし、血液供給が激減または遮断され、その結果、対応する心筋に重篤で長期間持続する虚血が生じ、急性冠症候群に属する。 症状は疼痛、不整脈、全身症状である。
(1)疼痛：多くは心前庭部の圧迫様疼痛で、より重篤で数時間以上の長時間持続し、左上肢尺側、下顎、左肩に放散することもある。
(2)不整脈：主な症状は動悸で、倦怠感、めまいなどを伴うことがあり、心室性不整脈が最も多い。
(3)全身症状：発熱が出現することがある。激痛がある場合は、頻回の吐き気、嘔吐、心窩部痛を伴うことが多い。