卵巣孔の検査は主に超音波検査で行われ、卵巣孔が閉鎖していない3歳以上の幼児は速やかに受診する必要がある。
診断には経胸壁心エコー、造影経頭蓋ドプラ超音波検査などの超音波検査などの画像診断が行われる。 心臓カテーテル検査も行われ、卵円孔開存症の有無を直接確認することができる。 心電図やX線検査では通常、異常はみられない。
卵巣孔開存症の治療は、主に介入療法や手術が行われ、専門機関で行われるべきものである。 日常的な注意としては、激しい運動を避け、安静にし、栄養のバランスを保ち、衣服の増減に注意し、風邪やインフルエンザを予防し、人が集まる場所に行く回数を減らし、辛いものや刺激物を控えることである。