ヤギ乳と牛乳はどちらも栄養価の高い乳製品だが、ヤギ乳の栄養構造は母乳に近く、摂取後の吸収は牛乳より良い。
山羊乳のタンパク質の固まりは牛乳より細かく柔らかく、脂肪粒子の体積は母乳に近いため、人体で消化吸収されやすく、ほとんどの人が胃部不快感や下痢などの不耐症を起こしにくく、乳幼児や高齢者などの摂取に適している。
また、牛乳の摂取で気になるのはタンパク質とカルシウムの含有量だが、一般的にヤギ乳のタンパク質は牛乳よりやや多いが、カルシウムの含有量はさほど変わらない。 ただし、ヤギのミルクに含まれる葉酸の含有量は非常に少ないため、ヤギのミルクを飲む際には、栄養のバランスにも気を配る必要がある。