新生児の中等度の脳損傷には、脳保護剤の適用、操作的リハビリテーション療法などが有効である。
1.脳保護剤の使用：生後1ヵ月未満の新生児には、ガングリオシドやラット神経成長因子などの脳保護剤を使用して、神経細胞の保護を改善し、脳浮腫による神経細胞の損傷を軽減することができる。 また、低体温療法や亜低体温療法により、脳損傷を緩和することもできる。
2.操作的リハビリテーション療法：体重4kg以上、生後40日以上の新生児には、運動療法、伝統的マッサージ、按摩、小児カイロプラクティックなどの治療法がある。また、脳波バイオニック療法、脳の磁気療法、水治療法、幼児水泳、薬湯などの物理的要因も利用できる。
中等度の脳損傷を受けた新生児は、速やかに治療を受け、定期的な検査を受け、積極的な治療のために医師と協力すべきである。 上記の薬剤はすべて医師の指導のもとで使用する必要があり、副作用を避けるためにやみくもに自己判断で使用してはならない。