高気圧酸素で神経損傷を治療する場合、治療期間は損傷の程度によって異なり、通常は1～6ヵ月間である。 外傷性脳損傷、脳梗塞、脳出血、その他の中枢神経損傷の患者の場合、高気圧酸素治療は通常10日ずつ2～3コース必要である。 治療後、患者の状態を総合的に評価し、効果があれば治療を中止し、そうでなければ高気圧酸素室治療を継続する。 脊髄神経損傷患者の場合、高気圧酸素治療は3～6ヵ月と長く、10日間を1コースとし、2コースの間に1～2日の休養を挟むため、少なくとも10コースが必要となる。 高気圧酸素療法を受ける患者は、医師による評価とモニターが必要で、高気圧酸素療法の効果には個人差がある。 また、患者は安静に注意し、過度の疲労を避け、定期的にリハビリ訓練を行い、神経機能をできるだけ回復させる必要がある。