B型肝炎ウイルスはヒトの肝細胞の核と一体化しており.老化した肝細胞が死滅した後.新しい肝細胞が作られ.B型肝炎ウイルスも一緒に再生されるため.B型肝炎ウイルスは肝細胞内に長期間.あるいは一生存在します。 HBVDNAはB型肝炎ウイルスの複製のマーカーであり.複製の程度には速い.遅い.高い.低いがあり.HBVDNA価の高さはB型肝炎ウイルスの複製能力の強さとB型肝炎ウイルスの伝染性の程度を示すだけである。 HBVDNAは抗ウイルス治療の条件ではありますが.決定的な条件ではありません。 ALTが正常値上限の2倍以上に上昇した状態でHBVDNAが一定以上の力価に達した場合.または肝穿刺でG2またはS2が認められた場合.または中等度の肝弾性線維症（肝硬変）が認められた場合にのみ抗ウイルス療法を行うことができます。肝硬変の所見がある患者には.HBV DNAとALTに関係なく抗ウイルス療法を行うことができます。 また.HBVDNAは抗ウイルス療法の有効性を判断する基準の一つとして用いることができ.HBVDNAが徐々に減少する場合は抗ウイルス療法が有効であることを示し.抗ウイルス療法を何ヶ月続けてもHBVDNAが減少しない場合は有効性が低いことを示し.HBVDNAが短期間に急速に減少する場合は抗ウイルス療法の有効性が高いことを示しますが.HBVDNAが減少した後に10倍程度の上昇に転じる場合は薬剤耐性の発現を示します。 要するに.抗ウイルス治療の可否はHBV DNAに依存し.治療の条件が整わない場合は.やみくもに治療することはできず.適切な時期を待たなければならない。そうでなければ.治療は逆に治療効果を低下させ.薬剤耐性を誘発し.体の自己免疫バランスを乱し.一生治らないことさえある。