嫌気性血液培養ボトルと好気性血液培養ボトルの区別は、ボトルの分類表示、キャップの色、ボトル内のガスおよびボトル内の培地によって行うことができる。
1.ボトルの分類表示：嫌気性ボトルにはSN、好気性ボトルにはSAの表示がある。
2.キャップの色：嫌気性ボトルのキャップの色は紫、好気性ボトルのキャップの色は青。
3.ボトル内のガス：嫌気性ボトル内のガスは窒素に10％のCO2を加えたもので、嫌気性菌の増殖に適したガス環境となる。好気性ボトル内のガスは酸素に10％のCO2を加えたもので、好気性菌の増殖に適したガス環境となる。
4.ボトル培地：嫌気性ボトルには、40mlのトリプチカーゼ大豆ブロスまたは脳心筋梗塞、真菌および嫌気性栄養添加物を含む；好気性ボトルには、40mlのトリプチカーゼ大豆ブロス、真菌栄養添加物を含む。
まとめると、血液培養瓶は上記の4つの方法に基づいて嫌気性と好気性を区別することができる。