巣状増殖性IgA腎症は比較的軽症のIgA腎症であり、ホルモン剤（酢酸プレドニンなど）で治療可能である。
巣状増殖性IgA腎症の病理所見は、糸球体がチラコイド増殖しているように見えることであり、通常、三日月生成と糸球体硬化はほとんどみられない。 したがって、IgA腎症の中では比較的軽症なタイプであり、患者の状態に応じて治療方針を総合的に検討する必要がある。
扁桃腺感染後に肉眼的血尿や尿検査異常が出現した場合には、積極的に感染をコントロールする必要がある。 ペニシリン、エリスロマイシンなどの非腎毒性抗生物質の一般的な使用や、早期の扁桃摘出手術を行う。 また、蛋白尿を減らすだけでなく血圧をコントロールするためにエナラプリルやバルサルタンも考慮される。
蛋白尿が持続したり、上記の治療が有効でない場合は、ホルモン療法が考慮されます。 酢酸プレドニゾンが一般的で、重症でホルモン療法が無効な場合や、病型が巨大な三日月形成を示唆する場合は、免疫抑制剤（シクロホスファミドなど）を併用する。
上記の薬剤は、医師の指示に従って使用する必要があり、巣状増殖性IgA腎症の患者は、関連する検査を改善し、医師の指示に従って標準的な治療を行うために、時間内に通常の病院に行くことをお勧めします。