酸性フォスファターゼは全身の組織に広く存在し、男性では酸性フォスファターゼの1/3～1/2が前立腺から、女性では主に肝臓、赤血球、血小板から生じる。 高値は以下の疾患でよくみられる：
1.前立腺疾患：前立腺がん、前立腺炎、前立腺肥大症など。 酸ホスファターゼ検査は、前立腺癌の鑑別診断に用いられることが多いが、特に前立腺癌に骨転移がある場合、指数が有意に上昇することがあるため、他の検査項目を用いて総合的に分析する必要がある。
2.骨疾患：骨腫瘍、腫瘍の骨転移、代謝性骨疾患など。
3.肝疾患：肝硬変、肝細胞癌、肝炎など。
4.血液疾患：溶血性貧血、白血病、血小板減少症、副甲状腺機能亢進症など。
酸性フォスファターゼの上昇だけでは診断は確定できないので、他の検査結果と組み合わせて診断を明確にする必要がある。 酸性フォスファターゼの上昇が認められた場合には、適時に医師に相談し、医師の指示に従って明確な診断を下し、病状を長引かせないように適時に治療を行うことが必要である。