小児が梅毒に感染しているかどうかを調べるには、梅毒血清学的検査、梅毒スピロヘータIgM抗体検査、分子生物学的検査、暗視野顕微鏡検査を以下のように用いることができます：
1.非梅毒スピロヘータ血清学的検査：梅毒に感染した小児は通常この検査で陽性となる。 胎児梅毒の場合、抗体価が母親の抗体価の4倍以上であるか、3ヵ月間の経過観察期間中に抗体価が上昇する傾向があれば、梅毒に感染しているとみなされる。 なお、この検査は自己免疫疾患により偽陽性を示すことがあるので、他の検査と組み合わせて総合的に判断する必要がある。
2.梅毒スピロヘータの血清学的検査：梅毒に感染した小児は通常、免疫グロブリンの一種であるIgM抗体が陽性であり、高感度で梅毒の早期診断に利用できる。 通常、IgM抗体が陽性であれば梅毒の確定診断に役立ちますが、陰性であっても梅毒の感染を否定することはできませんので、他の検査と組み合わせて総合的に判断する必要があります。
3.分子生物学的検査：分子生物学的検査は、梅毒を特異的に検出するためのPCR技術の使用であり、この検査法は良好な検査条件を必要とするだけでなく、検査における豊富な技術的経験を必要とする。
4.暗視野顕微鏡検査：梅毒に感染している子どもは、通常、掻爬後の皮膚病変から検出することができますが、陰性だからといって梅毒に感染していないわけではなく、他の検査と組み合わせて総合的に判断する必要があります。
梅毒に感染している疑いのある子どもについては、明確な診断の後、専門の医師の指導のもとで検査と標準的な治療を受けるために、通常の病院に連れて行くことを親は勧められる。