HIV患者におけるHIV抗体陰性は、誤診または偽陰性、空白期間、抗体産生に影響を及ぼす疾患などを示す可能性があります。
HIV抗体検査には、一次スクリーニング検査と確認検査があります。
1.誤診または偽陰性：過去にAIDSの明確な診断がない場合、ウイルス抗体が陰性でもAIDSではない可能性があります。 また、誤診につながる機器検査の問題があり、機器の感度が十分でないために偽陰性になることもあります。
2.ウィンドウピリオド：ハイリスク行動後、抗体が検出されるまでには通常一定期間が必要で、この期間をウィンドウピリオドと呼びますが、その長さには個人差があるため、ハイリスク行動から3ヵ月後にウイルス抗体を再検査することが推奨されています。
3.抗体産生に影響する疾患：急性白血病などの重篤な免疫系疾患や重篤な自己免疫疾患を患っており、ハイリスク行動前に免疫抑制剤を服用している場合、免疫系が低下してHIV抗体が陰性となるため、直接P24抗原検査とHIV核酸検査を実施する。
HIV抗体が陰性であるHIV患者は、再度検査を受けることが推奨され、HIVに感染しているかどうかを明らかにするために核酸検査を行うこともできる。