アフラトキシンは、体外であれば日光や紫外線、アルカリ性にさらすことで除去できる。 アフラトキシンは強い生物毒性を持つ化合物である。 一般に、分解するためには260℃以上の加熱が必要である。 アフラトキシンが体外にある場合は、日光に当てることで殺菌・滅菌の効果を得ることができ、乾燥した風通しの良い環境であれば、アフラトキシンの増殖を抑制することができる。 また、重曹や食卓塩などのアルカリ性物質でアフラトキシンを死滅させることができる。 また、紫外線ランプを使用してアフラトキシンを除去することもできる。 アフラトキシンは人体に入ると主に肝臓で代謝され、肝臓障害や肝臓癌を引き起こす可能性がある。 したがって、食品にアフラトキシンが含まれている場合は、体への悪影響を避けるために摂取しないようにしよう。