患者が大腸内視鏡検査に耐えられるのであれば、一般的には無痛より通常の大腸内視鏡検査の方がよい。 無痛大腸内視鏡検査、通常大腸内視鏡検査にかかわらず、下剤を飲んだ後、肛門から大腸内視鏡を入れて腸管壁の粘膜を観察し、腸炎や異物産生の有無を明らかにする。 しかし、無痛大腸内視鏡検査は麻酔が必要であり、体位に協力が必要な場合、通常の大腸内視鏡検査に比べ協力が得られない。 また、無痛大腸内視鏡検査では麻酔薬を注射する必要があり、患者のアレルギーや副反応の発生が増えるため、通常の大腸内視鏡検査には劣る。 また、通常の大腸内視鏡検査では、患者にある程度の意識があるため、不快感がある場合、適時に救助することができるが、無痛大腸内視鏡検査では、患者の状態を明らかにするために監視する必要があるため、病状の発見が遅れる可能性がある。