牡蠣の殻は牡蠣であり、薬の臨床的効能は、陽気を昇華させ、陰気を補い、精神を再静穏化させ、節々を和らげ、分散させるなどである。しかし、湯を沸かして飲んでも治療効果はほとんどなく、薬の代用にはならない。 一般的には煎じて内服する必要がある。
牡蠣は肝陽を鎮める薬に属し、臨床的には陽気を鎮めて陰気を補うことができるので、特に肝陽の亢進（肝陽が過剰になり、めまいや立ちくらみ、頭痛などを起こす）による頭痛、目の充血や腫れ、めまいや耳鳴り、手足のしびれなどに効果があります。
また、牡蠣は心を落ち着かせ、動悸（激しい心臓の鼓動やパニック）、心身の落ち着きのなさからくる不眠や不眠症などの症状にも効果がある。
さらに牡蠣は、瘰癧（主に頸部リンパ節結核を指す）、痰核、腹部腫瘤（しこり）に対して軟化散剤の役割を果たし、自汗・盗汗、精液漏・精液下漏などに対して収斂・収斂の役割を果たすことができるが、水煮にすれば、心霊の乱れの症状に用いることができる。
ただし、牡蠣は水煮にすると薬の代わりにはならない。 また、禁忌が明確でないため、医師の指示に従って服薬することを勧め、身体の不調は適時に医師に相談する必要があり、薬剤は医師の指導の下で使用する必要がある。