ネオコロナウイルスは感染していればいつでも検出できる。 現在、ネオコロナウイルスの核酸検査にはリアルタイム蛍光RT-PCRが用いられている。 CDCのスタッフが咽頭ぬぐい液を使ってヒトの咽頭から少量の分泌物を掻き出し、CDCの研究室に持ち帰り、逆転写ポリメラーゼ連鎖反応（RT-PCR）技術を用いて遺伝子レベルでウイルスの存在を検出します。 潜伏期の患者は臨床症状がなくても感染しており、新型コロナウイルスが体内に存在しているが、ウイルス量の不足、採取場所の影響、試薬の感度などにより偽陰性になることがあるので、核酸検査を数回繰り返す必要がある。 関連する疫学的既往歴のある人は、率先して地元のCDCに報告し、医学的観察のために集中的に隔離されるべきであり、その間、必要に応じて核酸検査に参加すべきである。