エリテマトーデス脳症の余命は通常10年以上であり、中には20～40年生存する患者もいるが、発病時の年齢が高く、脳梗塞などの重篤な合併症がある場合は、余命が10年に達しないこともある。 しかし、正確な余命は患者さんの年齢や重症度によって判断する必要があり、明確な生存期限はありません。 患者が若く、精神症状が軽度で、けいれんや一過性虚血発作が少なく、重度の脳梗塞や神経障害がなければ、早期介入と標準化された免疫抑制治療により、患者の生存率は比較的高く、一般的な余命は10年以上、中には20～40年生存できる患者もいる。 基礎年齢が高く、重度の脳梗塞、脳神経障害、てんかん発作などがある場合は、生存率は低くなり、余命は10年に達しないこともある。 また、重篤な基礎疾患を有する患者も余命に影響を及ぼすことが知られている。 エリテマトーデス脳症患者の生存率も、患者の重症度によって判断する必要があり、関連する違和感があれば、時間内に病院へ行き、医師の指示に従って標準的な診断と治療を行い、定期的に経過観察を行うことが推奨される。