肛門周囲膿瘍は通常自然治癒は不可能で、切開排膿などの治療による介入が必要であり、必要に応じて抗生物質の塗布を行うが、通常は予後が良好である。 1.肛門周囲直腸膿瘍:通常、膿の形成の有無にかかわらず、切開排膿による治療が行われ、診断後は速やかに切開排膿すべきである。 2.内オリフィスに明らかな瘻孔形成がある:単純な肛門瘻孔、または再発リスクの高い馬蹄形の膿瘍であれば、肛門瘻孔切開術を考慮する必要がある。女性の前外側膿瘍、リスクの高い複雑な膿瘍では、瘻孔が形成されていても、切開排膿するか、ドレナージをフックアップする必要がある。 3.重篤な直腸肛門周囲膿瘍:セファロスポリンなどの抗生物質の使用を考慮する必要があり、全身性感染症、免疫抑制、糖尿病、心臓弁膜症患者は抗生物質の抗感染剤で治療する。 肛門周囲に違和感がある場合は、速やかに通常の病院を受診し、医師の指示に従って対症療法を行うことをお勧めします。