これらの良性病変では.グリコーゲン抗原199U/mlは一過性に上昇することが多く.濃度はそれほど高くありません。第3のケースでは.胆嚢癌.肝臓癌.膵臓癌.大腸癌.胃癌など.主に消化管の腫瘍で.消化管の原発腫瘍や転移性腫瘍のある悪性病変に見られる場合があります。 グリコーゲン199U/ml濃度は.通常.腫瘍を摘出すると減少するが.再発すると再び増加する。 これらの腫瘍を放射線治療で治療し.病状がコントロールされると.グリコーゲン199U/ml濃度も大きく減少するので.治療効果の指標として用いられることが多い。