慢性淋菌感染症は、根絶するまでに2ヵ月以上の治療が必要で、少数の症例では長期間持続することもあり、治療プログラムを適時に調整する必要がある。 この病気は急性淋病の遷延によって引き起こされ、男性では尿道刺激症状と尿道からの分泌物、ほとんどの女性では軽い症状である。 慢性淋菌感染症567例を対象とした報告によると、臨床的治癒率（通常「除菌」と呼ばれるもの）は83.77％であり、そのうち除菌治療に要した期間は回復した患者全員が2ヵ月以上であり、2ヵ月で除菌治療を受けた者の割合は36.68％、3〜6ヵ月では25.40％であった。 罹病期間は治療の標準化と耐性菌に関係している。 慢性淋病の診断がついたら、専門医の指導のもとで標準化すべきであり、治療期間が長引く場合は、薬剤感受性検査の抗感染プログラムに従って調整すべきである。 同時に、虚偽の広告に盲目的に耳を傾けることを避け、性的安全の意識を向上させ、不潔なセックスを拒否する。