一般に、コーヒーにはカフェインが含まれているが、下痢を引き起こすことはない。 コーヒーを飲むと下痢をする患者は、冷やしすぎたコーヒー、劣化したコーヒー、コーヒーアレルギーなどが原因である可能性がある。
コーヒーには腸管を刺激するような成分は含まれていないため、胃腸の正常な蠕動運動には影響を与えず、下痢を起こすことはないが、冷やしすぎて腸管を冷やしたり、劣化したコーヒーを飲んで胃腸炎を起こしたり、コーヒーアレルギーで腸管粘膜が浮腫んだりすると、腸管の働きに影響を与え、腸の蠕動運動が過剰になり、下痢を起こす。
コーヒーは腸管を刺激しないので、一般的に普通のコーヒーを飲むだけでは下痢にならないが、患者がコーヒーを飲んで下痢になった場合は、できるだけ早く下痢の原因を突き止め、その原因に対処する必要がある。