脾虚で便がゆるく、肺虚で咳や喘鳴がある人には、しその実の水煮は禁忌であり、気虚、陰虚、温病の人には、しその葉の水煮は禁忌である。
シソの成熟果実を乾燥させたものがシソの実、乾燥したものや葉の新芽を乾燥させたものがシソの葉、乾燥した茎を乾燥させたものがシソの茎で、伝統的な漢方薬であり、お湯を沸かして飲むのに用いる。
しその実は肺経に属し、咳喘息、下剤、気痰降下作用があり、便秘、咳喘息、痰の鬱結、気の逆流によく用いられ、肺虚の脾臓、緩便、咳喘息には禁忌である。
しその葉は温性で辛味があり、肺と脾の経絡に属し、気と胃を動かし、寒を払い、症状を緩和する作用があり、風寒の風邪、妊娠中の嘔吐、咳嘔吐などによく用いられる。本剤は気虚、陰虚、温病の患者には用いない。
シソの茎は脾経と肺経に入り、胎児を鎮め、痛みを和らげ、また気を整え中を広げる（脾胃の気を整える）ので、胎児の落ち着きのなさ、胃痛・心窩部痛、胸部・横隔膜の収縮などに効果があり、この薬にアレルギーのある人には使用しない。
シソは部位によって効能が異なるため、薬の具体的な使用方法は同じではなく、専門の漢方医の指導を受けた上で、患者の実際の状態に合わせて組み合わせる必要があり、個人はやみくもに無差別に使用すべきではない。 同時に、漢方薬の沸騰水の効果は限られている、やみくもに自己治療しないでください。