生検を伴わない大腸内視鏡検査の診断意見は一般に正確である。 大腸内視鏡検査を行う際、執刀医が病変に疑問を持ったり、明らかな悪性病変があると判断した場合には、生検を行い、病理結果が出るのを待って病変の種類をはっきりさせる必要があり、この時の大腸内視鏡検査の報告書の診断も一般的には正しいが、ただ病理結果が良い結果なのか悪い結果なのかがわからず、治療方針を立てるのに不便である。 大腸内視鏡検査で明らかな悪性病変が発見されなかった場合のほかに、患者さんが抗血小板薬（アスピリンなど）の内服を3〜7日間中止していない場合、出血の危険性があるため生検を行わないことがあります。 この時点で問題が見つかれば、投薬中止後に大腸内視鏡検査を繰り返し、生検を行うことができます。 一般的には、医師が専門的な知識と経験に基づいて生検を行うかどうかを決定し、慎重に報告書を書いて患者に渡しますので、診断は一般的に正確です。