若年性特発性関節炎に対する投薬の中止は、通常、症状が完全にコントロールされ、すべての指標が正常に戻ったときに、医学的助言に基づいて行われる。
若年性特発性関節炎の治療の第一目標は、臨床的寛解、すなわち発熱、発疹、関節炎などの臨床症状が減少し、血液沈降速度（HSR）やC反応性蛋白（CRP）などの炎症マーカーが正常に戻ることである。
これらの目標を達成した後は、患者が臨床的寛解状態を長期間維持できるように疾患活動性をモニタリングし、投薬中止後に寛解という最終目標を達成できるように、医師の指示に従って徐々に減薬していく必要がある。
若年性特発性関節炎の患者さんは、できるだけ早く寛解を得るために、定期的に病院を受診し、医師の指導のもと標準的な診断と治療を受け、定期的な経過観察を受け、予後に影響を与えないように、自己判断で薬を中止するのではなく、医師の指示に従って減量・中止することをお勧めします。