慢性副鼻腔炎は積極的な治療により予後が良くなり、一般的には患者の余命には影響しないが、適時に治療を受けないと頭蓋内感染を起こすことがあり、重症の場合は生命にかかわることもある。 慢性副鼻腔炎は急性副鼻腔炎から発展することが多いが、副鼻腔の解剖学的要因、外傷、歯原性感染症なども関係している。 慢性副鼻腔炎の患者には、ブデソニド点鼻薬などの鼻用グルココルチコイド、アモキシシリン・クラブラン酸カリウム、セフロキシム、ロキシスロマイシンなどの抗菌薬、キョウチクトウ、ユーカリピネナール腸溶性ソフトカプセルなどの粘液分泌促進薬、ヒドロキシメタゾリン塩酸塩点鼻薬などの鼻腔充血除去薬（通常7日以内の使用）、鼻汁をきれいにする生理食塩水による鼻洗浄などの薬物療法が行われる。 明らかな構造異常のある副鼻腔；鼻副鼻腔複合体や副鼻腔排液に影響を及ぼすポリープ；標準化された薬物療法を12週間以上行っても満足のいく症状の改善が得られない場合；頭蓋内および眼窩内合併症のある副鼻腔は、経鼻内視鏡下での開頭副鼻腔手術により外科的に治療することができる。 慢性副鼻腔炎が標準化された治療を受ければ、予後は良好であり、患者の生存期間には影響しない。 しかし、適時に治療を行わないと、眼窩内感染や頭蓋内感染を引き起こす可能性があり、重症の場合は患者の生命を脅かすこともある。 慢性副鼻腔炎の患者さんは、病状を遅らせることのないよう、時間内に病院へ行き、積極的に医師の治療に協力することをお勧めします。