長期腟内薬物挿入は、腟内環境の破壊や薬剤耐性の生成などの副作用を生じる可能性がある。 1.膣内環境の破壊：膣内には乳酸桿菌や大腸菌などの正常な膣内細菌叢やその他の病原性細菌が存在するため、膣剤を長期間使用すると乳酸桿菌が破壊されたり、局所のpHが変化したりして、他の病原性細菌が繁殖しやすくなり、膣炎が発生しやすくなる。 2.薬剤耐性の発生：膣炎患者にとって、ニフルチモックス、ビサコジル坐剤などの長期使用は、局所の病原性細菌に薬剤耐性を発生させやすく、膣炎が再発した場合、これらの薬剤の使用による治療効果が大幅に減少するか、あるいは効果がないことさえある。 膣栓が必要な患者には、医師の指導のもとに使用すべきであり、上記の副作用を避けるためにやみくもに使用すべきではない。