尿管石灰化の軽症例では、定期的な経過観察を行いながら保存的治療を行うべきであるが、重症例や合併症のある症例では、適時手術を行うべきである。 軽症の尿管石灰化症患者は、通常、正常な尿の排泄過程に影響を及ぼさないため、通常、水分を多めに摂取し、排尿量を増やすなどの保存的な治療を行い、一般的には特別な治療を必要としない。 重症例では尿管狭窄をきたし、重症例では水腎症を生じることがあり、重症例では手術による治療が必要である。 尿管内視鏡で尿管に入り、石灰化した部分を切除したり、石灰化がひどい場合は、その場所の尿管を切断して尿管端から端まで吻合することもあります。 患者の体調が悪い場合は、医師に相談して検査と早期治療を受ける必要がある。