新生児高乳酸血症は先天性と後天性に分類され、先天性の場合は主に血液中の乳酸濃度を低下させる治療が行われ、後天性の場合は抗感染薬、容量拡張、酸補正、微小循環改善などの治療が必要となることが多い。
新生児が先天性新生児高乳酸血症で生まれた場合、治療にはアシドーシスの症状を改善する硫酸亜鉛、ビタミンB2、ビタミンKの投与が行われることが多く、患者によっては薬の投与量を増やすこともある。
感染症など後天的な原因による場合は、抗感染治療を行う必要があり、医師の指導のもと、アモキシシリン、セファドロキシルなどの抗生物質を内服する。
新生児高乳酸血症は、健康に影響を与えないように、積極的に医師と協力して治療を受ける必要がある。