小児のEBV感染症は一般に重症で、主に伝染性単核球症を引き起こすが、小児リンパ腫、上咽頭癌などもある。 EBVは主に小児や青少年に感染し、通常は口腔から感染し、咽頭で増殖して扁桃炎や咽頭炎の症状を引き起こし、血流に入り、全身のリンパ系を巻き込み、心臓、肝臓、腎臓、肺、皮膚、中枢系およびその他の重要な臓器に浸潤し、壊死病巣が限定的に存在することがあります。 EBVに感染した小児は通常、再発性の高熱、扁桃腺肥大、咽頭痛、全身のリンパ節腫大、肝臓や脾臓の腫大を呈し、多形性の発疹などを伴う。 少数の小児では回復が遅いか、心筋炎、髄膜脳炎、腎炎などの合併症が誘発され、数ヵ月間続き、重症例では生命を脅かすこともある。 したがって、EBV感染症の子どもは、医師の指示に従って標準的な治療を行い、少しでも違和感があればいつでも医師に相談し、症状を遅らせることのないよう、怠らないようにすることが勧められる。