ラジオ波焼灼術後の合併症として多いのは、不整脈の再発、穿刺部位の損傷、血栓症、出血などである。
1.不整脈の再発：ラジオ波焼灼術を行うと、焼灼部位に壊死領域が形成され、その周囲に炎症性水腫領域が形成されます。 不整脈の原因となっている病変が壊死領域ではなく、炎症性水腫領域にある場合、炎症や水腫が治まると再び不整脈が再発します。
2.穿刺部位の損傷：ラジオ波焼灼術は血管穿刺を必要とするインターベンションであり、穿刺部位に血腫、紅斑、あるいは仮性動脈瘤が出現することがある。
3.血栓症：ラジオ波焼灼術は血管穿刺を必要とするため、術後の圧迫の過程で血栓症が生じ、四肢の虚血や打撲の症状を呈することがある。
4.出血：ラジオ波焼灼術では血栓症を予防するために、一般的にある種の抗凝固薬や抗血小板薬をルーチンで経口投与しますが、これらの薬剤は歯ぐきの出血や鼻血などの出血傾向を引き起こす可能性があります。
ラジオ波焼灼療法を受ける不整脈患者は、通常の病院を受診し、専門医の指導のもとで慎重に治療法を選択しなければならない。