よもぎ茶には月経を温め、痛みを和らげる作用があるが、過剰摂取すると痙攣、せん妄、嘔吐、めまい、麻痺などの副作用が現れることがあり、陰虚血熱には注意が必要である。
よもぎは性質が温性で、味が硬く、毒が少ない。 効能は散寒解痛、整経、鎮胎、温経、止血。
上腹部の冷痛（胃や腹部の冷痛）、月経不順、胎便漏（妊娠初期の少量の膣出血）、出血、子宮冷えを伴う不妊症、過多月経、胎動不安、鼻出血、月経過多症（月経過多や月経滴下）などに用いる。
陰虚、血熱のある人は、よもぎの過剰摂取により、けいれん、せん妄、吐き気、嘔吐、耳鳴り、めまい、手足の震え、全身の脱力感、麻痺などの副作用を起こすことがあるので注意が必要である。
よもぎは薬として煎じられることが多く、お茶の代用品としての有用性は限られている。 体調が悪いと感じたら、できるだけ早く医師の診断を受け、医師の指導のもとでヨモギを摂取することをお勧めします。