腸管形質転換に対する最も効果的な治療法はなく、治療法は個人差がある。 漢方薬では、桂枝茯苓丸、茯苓、柴胡、香附子などを併用することで治療が可能であるため、適時医師に相談し、医師の指示に従うことをお勧めする。 腸化膿症は西洋医学の概念であるが、漢方では肝胃不和（上行する肝と下行する胃の不調和）、湿熱閉塞（湿と熱が蓄積してうっ滞を形成する）、熱毒凝聚（熱毒が凝集する）、瘀血が胃を閉塞する、あるいは脾胃が虚弱である、胃陰虚（胃の陰液が不足する）などの証に応じて治療できると考える。 患者は通常、心窩部不快感、腹痛、胃酸逆流、腹鳴（しゃっくり）、胸やけ（胃や胸骨後方の灼熱感）などの症状を呈する。 漢方では、脾胃虚弱による腸重積症には、柴胡と香附子を併用し、脾胃虚弱による腸重積症には、柴胡、茯苓などを併用する。 このうち、柴胡は抑肝散（肝の気の滞りを解消してうつ病を治療すること）、香附子は気を整え、肝の痛みも和らげる、沢瀉は脾を強めて気を充実させる、茯苓は脾を強めて心を静める作用がある。 これらの薬剤は、腸管ケモシスの上記の症状を治療するのに用いることができる。 治療が必要な患者さんは、早めに医師に相談し、医師の指導のもとで投薬などの治療を受けることをお勧めする。